О «войне спецслужб». Моя версия.

Арестованный генерал из Госнаркоконтроля   Александр Бульбов, как известно курировал дело «Трёх китов», расследование которого президент лично велел довести до конца и держал его на контроле. А это значит, что все, кто курировал и вёл это расследование, находились под защитой президента и любые действия против них могли произойти только с санкции президента. Ясно, что  им дали беспрецедентно широкие полномочия и возможности для работы во вверенном им направлении. 

Почему президент мог позволить этот арест?

Возможно, этот провинциальный генерал влез туда, куда влезать был не должен. То есть он злоупотребил теми возможностями, которые ему были даны, и влез далеко за рамки дела «Трёх китов». И скорей всего то, куда он влез, никак не связано было с «Тремя китами» и коррупцией, а связано было с его желанием стать «крупной фигурой», «попасть из грязи в князи». То есть банально у человека могло «сорвать башню» от данных ему возможностей и он «начудил». Его ведь обвиняют «в незаконном прослушивании»? Очень интересно, кого он там так «напрослушивал», что попал на нары? Явно не коррупционеров из «Трёх китов». 
А Черкесов просто вступился за своего сотрудника, считая, что принятые меры к нему излишне суровы – можно было и просто уволить по тихому, без «крутых мер».